员工造成店铺停业损失，需依法计算赔偿。依据相关法律规定，损失计算方式多样，如按房屋价值比例、面积或经营收入等确定。《国有土地上房屋征收与补偿条例》等法规为计算提供依据。不及时处理可能导致损失扩大，影响企业运营及权益。
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员工致店铺停业，处理需分情况：1. 若损失小，可协商赔偿，明确责任与金额；2. 损失较大时，邀请第三方评估机构评估损失，作为赔偿依据；3. 双方协商不成，可申请调解或提起仲裁、诉讼，依据《民法典》等法规维护权益。
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处理员工造成店铺停业损失，常见方式有协商、调解、仲裁或诉讼。应根据损失大小、责任归属及双方意愿选择合适方式。协商不成可考虑调解，仍无法解决则通过仲裁或诉讼维护权益。