单位应按规定处理职工生病经济补偿。依据《劳动合同法》，违法解除患病职工合同需支付二倍赔偿金，未及时处理可能导致法律纠纷和额外经济负担。
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单位应依法处理。具体操作：1.核实职工工作年限，按《劳动合同法》计算经济补偿金；2.若违法解除，需支付二倍赔偿金；3.主动与职工沟通，协商解决方案，避免纠纷。
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处理职工生病经济补偿，单位可协商调解或依法赔偿。应根据职工工作年限和合同情况，选择合适方式，确保合法合规，避免法律风险。