宅基地使用权补偿是按照面积来计算的，具体的补偿面积依据宅基地或建设用地使用权证书、房屋所有权证书所载明的面积为准。这样做是为了确保被征收人得到的补偿不低于其房屋的市场价格，从而保障其合法权益不受损害。
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对于宅基地面积的认定，应该依据合法批准文件，如有疑问或不确定的地方，建议及时向当地乡镇政府或拆迁部门咨询，以确保自己的权益得到妥善保障。在补偿方式上，也会根据实际情况进行合理的选择。
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在计算宅基地使用权补偿面积时，若拥有相关证书，则按照证书上载明的面积进行计算；若缺乏证书或面积不明确，则可以依据房屋所有权证书或市场评估价值来评估。确保补偿标准不低于市场价格，充分保障被征收人的合法权益。在遇到相关争议时，可以采取复核评估或专家鉴定等方式来解决。